宗喀巴大师闭关专修时,又在一块石板上,磕长头礼拜三十五佛。因大师礼佛修忏不畏艰苦,一味精进,以致手足俱裂,并在石板上留下手脚膜拜的凹痕和头额的印纹。大师礼拜三十五佛时,常感三十五佛现身加持。然而他每次所见到的三十五佛,却全部没有头部。他觉得很奇怪,因此就此事请问本尊。本尊回答说:“以后你必须在佛号前面,加诵如来、应供、正遍知、明行足、善逝、世间解、无上士调御大夫、天人师、佛、世尊,如此方能见到全身的佛相。”大师自此以后,每次修忏时,都遵照本尊所教,如法念诵,果然每次都可看到三十五佛的圆满相,尊尊光明相好,庄严无比,于是大师依此,造三十五佛的修观仪轨。
在此之前,印度和西藏的修行人,所谓修佛忏,只能依菩萨堕忏的仪文,一边诵佛,一边礼拜,而无观修之法。自从宗喀巴大师造修观仪轨之后,修法才算圆满,功德更为殊胜。