噶玛拔希在蒙古的时候，国王升天后，因浊世之罪过，王子兄弟们争夺王位时，发生大违碍，出现凶险的梦兆。王子忽必烈是最初邀请噶玛拔希的人，但他未住在彼处，故忽必烈对他不满。他又站在蒙哥汗一边，得到大量奉献，故忽必烈下令对他施行火烧、抛入水中、用兵器砍、喂毒、头上钉铁钉等刑罚，并派人分三班轮流看守，七天不准进食。此时，有金刚亥母前来，四部智慧空行母从哈拉哈坟墓中取来婆罗门女儿的尸体，举行会供。外界一切刑罚经四空行转授到尸体身上，故任何东西一点也不能够损害噶玛拔希。又有不动的二十四圣地之空行来吹气，东北方向出现吉祥天母的天兵四万四千人，降下大风、雷电和冰雹，瘟疫流行，行刑之武士顿时死亡。国王及其随从面前出现许多幻变情景及猛恶护法。至第七天，所有王臣俱生悔惧，祈请噶玛拔希原谅。他遂修习药师佛修法光辉，消除恶兆及瘟疫，故王臣无限敬仰，顶礼足下，加以敬奉和供养。他按照都松钦巴的预言愿回西藏，得到国王的同意。
噶玛拔希到达秋玛城和兴贡地方时，二十宗的全体百姓聚集，祈请修建寺庙，但未建。此时汉地的神鬼制造了违碍，他修持马头明王法加以镇伏，制伏神、鬼、人三种业障，此后返回西藏，到达楚布寺时，所有噶举喇嘛的本尊对他加持说:“从此你哪儿也不要去了。”故居于楚布寺，发展无数弟子僧人。
此时，怙主八思巴任皇帝的帝师，由朝廷返回西藏，在楚布寺二人会见。二人法座相平，不分上下。噶玛拔希对八思巴说:“以前我任蒙哥汗的应供喇嘛时，我看到你是菩萨降世，是多么高兴。”噶玛拔希建成楚布经堂佛像等工程，开光之时，到众救护神之前说:“所有神像和全部业果都是由我完成的，在未来之时，仍然按你的想法，普渡众生、教化遍布三界的僧徒之时，我仍然要护持佛教，完成我的事业。”后来，由杰瓦加措等入加持后，建观世音庙，并为僧人建诵嘛呢经之地和为乞丐施食的资金。
